El plantel de canes detectores esta compuesto por más de 40 perros de raza Beagle y Labrador Retriever. En una primera instancia se conformó obteniendo ejemplares de los criaderos más destacados a nivel nacional.
El plantel de perros fue creciendo en la medida de las necesidades operativas de FunBaPa. Este crecimiento se fue logrando a través de las crías obtenidas en el Centro de Adiestramiento y Reproducción de Viedma.
Además, Incan Trehua cuenta con canes de raza Border Collie, utilizados para el manejo de rodeos; Blood Hound, para el rastrillaje y seguimiento de pistas; y Terranova, para el salvataje acuático.
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