Los objetivos básicos del programa son los siguientes:
• Criar y adiestrar perros para la inspección y detección de productos y subproductos de origen animal y vegetal.
• Generar un equipo técnico que pueda capacitar a personas y entrenar canes de manera permanente.
• Complementar, agilizar y hacer más eficiente el trabajo de los inspectores en las barreras zoofitosanitarias internas y externas.
• Proveer de canes adiestrados en diferentes tareas al sector agropecuario.