Las zonas productoras de cebolla de la Región Protegida Patagónica son el Valle Medio e Inferior del río Negro y el Valle Bonaerense del Río Colorado. Otras regiones de menor relevancia son el Valle de General Conesa, el Alto Valle del río Negro y Neuquén y la zona circundante ala localidad de Río Colorado.
El Valle Bonaerense del río Colorado es la principal zona productora de cebolla de la Argentina. Se extiende sobre la desembocadura de este río al Mar Argentino y forma parte de los Partidos de Villarino y Patagones. Actualmente tiene una superficie regable de 140.000 has. El río Colorado el único curso de agua natural de la zona.
El cultivo de la cebolla empezó a fines de los años 70, y a partir de entonces mostró un incremento importante, debido principalmente a las excelentes condiciones agroecológicas, la infraestructura de riego, la época de cosecha y posibilidad de conservación y la disponibilidad de mano de obra. La superficie cultivada con cebolla varía anualmente entre 8.500 y 12.000 has.
La Región Protegida tiene una gran capacidad de manufactura porque cuenta con mano de obra calificada e infraestructura suficiente para procesar grandes volúmenes de cebolla, ya que todos los años se habilitan al menos 70 empaques, la mayoría en el Valle Bonaerense del río Colorado.